A partir del curso 2013-14 es preciso matricularse todos los años en el periodo de investigación del Programa de Doctorado que se esté realizando para poder constar como alumno de doctorado. Tal y como establece el Reglamento de Doctorado de la Universidad de Málaga, dejar de abonar las tasas anuales de matrícula ocasionará la baja del doctorando en el Programa de Doctorado.

Aquellos alumnos que actualmente tienen inscrito su proyecto de tesis y no han estado matriculados los últimos años, lo único que tienen que hacer es formalizar su matrícula. Esto podrán realizarlo a partir del 1 de Octubre de 2013,  utilizando un procedimiento electrónico. Estos alumnos no están obligados a pagar la matrícula de los cursos anteriores, ya que en esos cursos esta medida no era obligatoria. Aunque hasta Julio de 2013 no se conocerán las tasas oficiales para el curso 2013-14, las de este año son de algo menos de 60 Euros para el periodo de tutela del doctorado según consta en la Guía de Matriculación de la Universidad de Málaga.