OBJETIVOS QUE REFLEJAN LA ORIENTACIÓN GENERAL DEL TÍTULO
El objetivo general de este Máster es proporcionar al estudiante una formación avanzada de carácter especializado, a la vez que pluridisciplinar, y va dirigido sobre todo a una iniciación en tareas investigadoras, con una clara vocación de seguir proporcionando una formación investigadora de calidad, facilitando a los estudiantes alcanzar la titulación de Doctor, como prueba el hecho de que más del 70% de los estudiantes de los Programas de Doctorado predecesores de este Máster alcanzaron la mencionada titulación.
 
Su ámbito de conocimiento es el de las Ciencias de la Vida en general, y el de la Biología Celular y Molecular en particular, por ello se dirige a titulados universitarios en Biología, Bioquímica, Biotecnología, Ciencias Ambientales y otras ciencias biosanitarias o aplicadas afines.
 
Por tanto sus objetivos generales se podían resumir en:
 
1. Garantizar una formación multidisciplinar en el ámbito de la Biología Celular y la Biología Molecular a aquellos alumnos que acceden al Programa, a la vez que de una elevada y actualizada especialización en campos científicos concretos.
2. Proporcionar herramientas metodológicas y conceptuales a futuros investigadores, en proceso de formación, en el campo de la Biología Celular y Molecular, necesarias para abordar de una manera integrada su Tesis Doctoral, que le permitan abordar con la mayor amplitud de miras su “problema biológico”, sin tener que restringirse a los métodos y protocolos empleados en su laboratorio habitual.
 
Junto a estos objetivos generales es preciso tener en cuenta los objetivos específicos de cada una de las especializaciones definidas en el Máster. AsíLa especialización en Biología molecular, Biotecnología y Genómica permitirá una formación especializada en estructura, mecanismos de síntesis y regulación de macromoléculas biológicas que permita comprender como el desarrollo tecnológico en Biología Molecular proporciona herramientas muy útiles para la generación de información y el estudio de los procesos biológicos. Como objetivos de esta especialización se pretende :
 - Que los alumnos puedan afrontar el reto de cómo identificar, aislar, multiplicar y caracterizar a nivel molecular y funcional los genes que definen la complejidad de un organismo procariota o eucariota.
 
- Que los alumnos puedan aplicar los métodos y tecnologías de la Biología Molecular a la producción y caracterización de proteínas, la generación de plantas y animales transgénicos y las nuevas tecnologías genómicas.

Por su parte, la formación con una orientación de especialización académica e investigadora en el área de la Microbiología, prestará una especial atención a los microorganismos patógenos y los procesos patológicos que inducen en huéspedes de interés económico, como los cultivos vegetales y las especies animales acuícolas cultivadas. Por ello, este Título de Máster no sólo capacitará para abordar estudios de Doctorado en el campo de la Microbiología con una formación sólida y las máximas garantías de éxito, sino que además proporcionará una formación especializada complementaria para el desarrollo de la actividad profesional de los titulados en sectores estratégicos en Andalucía como la Agricultura, la Acuicultura o la Sanidad. 

La Bioinformática y las Tecnologías post-genómicas están acelerando enormemente la extracción de información de sistemas biológicos complejos, al permitir la obtención y el análisis masivo de datos. El análisis de esta información mediante la combinación de estas tecnologías confiere la posibilidad de un análisis global de la información y el descubrimiento de nuevas propiedades de los sistemas que no eran observables cuando se analizaban los elementos de forma individualizada. Varias disciplinas han participado de esta revolución reciente de la Biología, denominada BIOLOGÍA DE SISTEMAS, un campo emergente multidisciplinar, que se plantea abordar la comprensión a nivel de sistema de los procesos biológicos, más allá de los análisis fenomenológicos que han sido posibles hasta el momento, o de la capacidad de simple almacenamiento y extracción facilitada de información preexistente que aporta la bioinformática. Para incorporar o mejorar las herramientas de las tecnologías de la Biología de Sistemas y obtener el máximo beneficio de su potencial, es estrictamente necesario que los expertos de las distintas disciplinas implicadas sean capaces de hablar un lenguaje común, y que el número de profesionales capaces de mantener ese "bilingüismo" constituya una masa crítica suficiente para poder atender un ritmo de producción competitivo. Para conseguir este objetivo se necesita poder planear y ejecutar iniciativas de formación en el desarrollo de proyectos de integración de los datos biológicos con las herramientas de las ciencias de la computación. Desde este punto de vista, el objetivo global de esta especialización es generar en nuestra comunidad un núcleo de formación en Biología de Sistemas, con aplicación a problemas biológicos reales, y que llevaría a aumentar el material humano formado en I+D+I en nuestra comunidad, y surge como la evolución lógica del programa de Doctorado actual, que incluía cursos y líneas de investigación estrechamente relacionados con la Biología de Sistemas.

 
La especialización en Neurobiología estaría justificada por el espectacular avance registrado en la Neurobiología en los últimos años, que ha conducido a un mayor conocimiento de los mecanismos que subyacen al funcionamiento del cerebro. Estos avances han estrechado los vínculos de la Neurobiología con otras disciplinas, como la Biología del Desarrollo, la Genética o la Psicología y suponen un punto de partida estratégico para abordar temas de interés biomédico como aquellos relacionados con las enfermedades del sistema nervioso. Esta orientación partirá de unos fundamentos de biología de la neurona y organización general del sistema nervioso central para profundizar en el conocimiento de los mecanismos que subyacen a la actividad cerebral. Se prestará especial atención al conocimiento de los mecanismos implicados en el aprendizaje y la memoria y en procesos de envejecimiento y muerte neuronal, aspectos importantes por sus implicaciones en trastornos mentales y enfermedades neurodegenerativas. Esto proporcionará al Máster un interés añadido para profesionales no sólo de las Ciencias Experimentales, sino también los procedentes de los campos de Ciencias de la Salud. 

Por último la especialización en Biología del Desarrollo responde al interés creciente de esta parcela del conocimiento biológico, debido sobre todo al nuevo concepto de que el conocimiento de los procesos de desarrollo embrionario y diferenciación celular pueden contribuir de forma decisiva a la resolución de problemas de tipo médico. El esfuerzo investigador que se está derivando en los últimos años hacia las células madre y la Medicina Regenerativa es buena prueba de ello e ilustra el interés de proporcionar una formación adecuada en conceptos básicos y aplicados de Biología del Desarrollo. 

Por todo lo expuesto, este Título de Máster no sólo capacitará para abordar estudios de Doctorado en el campo genérico de la Biología Celular y Molecular con una formación sólida y las máximas garantías de éxito, sino que además podría proporcionar una formación especializada complementaria para el desarrollo de la actividad profesional de los titulados en sectores estratégicos en Andalucía como la Agricultura, la Acuicultura, la Biotecnología o la Sanidad. Este Master presenta un interés añadido para profesionales no sólo de las Ciencias Experimentales sino también los procedentes todos los campos de las Ciencias de la Salud.

COMPETENCIAS GENERALES Y ESPECÍFICAS QUE LOS ESTUDIANTES DEBEN ADQUIRIR DURANTE SUS ESTUDIOS.

Generales:

• Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, en un contexto académico o investigador.
• Aplicación de conocimientos y comprensión a través de capacidades de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares).
• Capacidad de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información incompleta.

• Capacidad de comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados y no especializados.
• Habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.
• Solidez en los conocimientos específicos de la profesión.
• Conocimientos avanzados que permitan abordar de forma integral las bases del funcionamiento de los sistemas biológicos.
• Capacidad de análisis y síntesis a partir del planteamiento de problemas genéricos.
• Resolución de problemas y casos prácticos, con especial énfasis en los de relevancia biomédica, fisiológica, tecnológico/industrial y/o medioambiental.
• Capacidad de toma de decisiones.
• Capacidad de crítica y autocrítica.
• Capacidad para aplicar la teoría a la práctica.
• Capacidad para trabajar en equipo y para hacer presentaciones en público.
• Adquirir familiaridad con el lenguaje especializado de la ciencia.
• Fomentar un ambiente de discusión y cooperación en la construcción de la asignatura.
• Fomentar una visión holista frente a la tentación del reduccionismo ontológico.
• Fomentar y practicar la transdisciplinaridad.

    
Específicas

• Desarrollo de la capacidad de asimilar conceptos avanzados a partir de la asistencia a un ciclo de conferencias científicas impartidas por expertos, tanto en español como en inglés.
• Diseño y exposición en público de un proyecto de investigación o del proyecto de trabajo de fin de máster
• Desarrollo de la capacidad de participar activamente en sesiones científicas.
• Conocer y comprender los detalles de los protocolos experimentales de las técnicas inmunohistoquímicas avanzadas.
• Conocer y comprender los detalles de los protocolos experimentales de las técnicas de microscopía electrónica de transmisión.
• Desarrollo de la capacidad de manejar el instrumental empleado en estas técnicas (microtomo, ultramicrotomo, microscopio óptico, microscopio confocal, microscopio electrónico).
• Desarrollo de la capacidad de aplicar técnicas inmunohistoquímicas avanzadas para microscopía óptica (incluyendo microscopía confocal espectral y multicanal).
• Desarrollo de la capacidad de aplicar técnicas para el análisis ultraestructural de células y tejidos a microscopía electrónica de transmisión.
• Conocer las principales tendencias en Filosofía contemporánea de la Ciencia.
• Adquirir destrezas en técnicas de cultivo celular.
• Adquirir destrezas en técnicas de citometría de flujo.
• Adquirir destrezas en técnicas de conservación de microorganismos.
• Adquirir destrezas en técnicas avanzadas de cultivo y observación de microorganismos.
• Adquirir destrezas para la correcta preparación de muestras y reactivos encaminados al análisis de ácidos nucleicos y proteínas.
• Adquirir destrezas para escoger los métodos adecuados para analizar un gen o una proteína concreta dentro de la complejidad de un organismo.
• Habilidad para realizar los métodos de análisis seleccionados.
• Capacidad de análisis e interpretación de resultados experimentales haciendo uso de los principios del pensamiento científico.
• Conocer los fundamentos y el funcionamiento de la gran instrumentación, así como de las herramientas computacionales mediante seminarios, prácticas de demostración y visitas guiadas a laboratorios de investigación.
• Analizar fenómenos dinámicos complejos mediante simulación o mediante reconstrucción en modelos de laboratorio sencillos.
  Comprender los mecanismos de señalización neuronal.
• Adquirir conocimientos avanzados sobre la naturaleza y funciones del aprendizaje y la memoria.
• Comprender los mecanismos celulares y moleculares fundamentales del aprendizaje y la memoria.
• Conocer las distintas categorías de aprendizaje y memoria.
• Distinguir los distintos tipos de memoria y los sistemas neurales implicados.
• Capacidad de manejar con soltura el vocabulario y la terminología características de la bioinformática.
• Adquirir conocimientos avanzados sobre la las herramientas disponibles, los sitios web adecuados, los sistemas operativos y las bases de datos.
• Conocer en detalle algunas de las herramientas de visualización molecular y portales de consulta como ENTREZ y SRS.
• Conocer cómo funciona un ordenador, básicamente al adquirir nociones básicas sobre los sistemas operativos, el desarrollo de webs en PHP y la programación en PERL.
• Ser capaz de relacionar las posibilidades de la aplicación de la bioinformática en relación a la biología molecular, la genómica, la proteómica y la biología de sistemas.
• Ser capaz de construir árboles filogenéticos fiables y conocer cuál es el algoritmo que ha de aplicarse para cada tipo de problema filogenético.
• Ser capaz de analizar los resultados de una micromatriz y evaluar la calidad de los datos antes de analizarlos.
• Perder el miedo a utilizar las herramientas bioinformáticas, incluso comprender que es necesario utilizar varias herramientas diferentes para el mismo análisis, para ganar así confianza en el resultado.
• Saber que las tareas rutinarias se pueden convertir en un script de PERL que nos facilitan el trabajo.
• Comprender la organización morfofuncional de la célula eucariota.
• Identificar los mecanismos de control del ciclo celular, reproducción y muerte celular, así como los procesos implicados en el cáncer.
• Ser capaz de distinguir las características estructurales y funcionales de los distintos tejidos animales - especialmente los de mamíferos- y vegetales.
• Ser capaz de identificar a microscopía electrónica las características diferenciales de los orgánulos y componentes celulares. Aprendizaje de las técnicas inmunocitoquímicas.
• Comprender la importancia y la relevancia de los microorganismos patógenos en la Microbiología y saber relacionar el estudio de los microorganismos patógenos con otras disciplinas biológicas afines.
• Conocer y manejar apropiadamente el vocabulario y la terminología característicos de la Microbiología de los microorganismos patógenos, así como las principales fuentes documentales de la disciplina.
• Adquirir conocimientos avanzados sobre la virulencia de virus, bacterias y hongos patógenos y conocer los mecanismos moleculares que les permiten causar enfermedades a sus hospedadores.
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  Identificar los mecanismos de defensa de hospedadores animales y vegetales frente a microorganismos patógenos, así como las principales estrategias empleadas por estos microorganismos para su evasión de los sistemas de defensa del huésped.
• Adquirir nociones fundamentales sobre las bases moleculares de la evolución de los agentes patógenos.
• Manejo de las herramientas y estrategias experimentales propias de la Biología del Desarrollo.
• Identificación de los principales sistemas de comunicación celular durante el desarrollo.
• Conocimiento de los procesos del desarrollo en sistemas-modelo (Drosophila, C. elegans, pollo y ratón).
• Aprender, manejar y aplicar a casos concretos los conocimientos disponibles sobre la base molecular del desarrollo.
• Adquirir en el laboratorio destrezas sobre las técnicas moleculares avanzadas para el estudio del desarrollo, incluyendo especialmente las técnicas de detección de la expresión génica.
• Adquirir comprensión de la base química y químico-física de la conformación de las macromoléculas y sus interacciones
• Adquirir conocimientos avanzados sobre los mecanismos moleculares in vivo de generación de macromoléculas tanto en células procariotas como eucariotas
• Adquirir la capacidad de entender y diseñar procedimientos avanzados de aislamiento y análisis de macromoléculas
• Adquirir la capacidad de identificar las características especializadas del metabolismo de las plantas
• Aplicar en el laboratorio técnicas especializadas de manipulación de ácidos nucleicos y adquirir la capacidad de planificación experimental en estudios de desarrollo y diferenciación
• Conocer y aplicar las herramientas genéticas de transformación de plantas y su uso para la generación de nuevos conocimientos
• Conocer con detalle y en términos moleculares especializados las principales características de las plantas y sus diferencias respecto a otros organismos, con especial énfasis en la captación de nutrientes, obtención de energía, procesos metabólicos asociados al desarrollo y diferenciación celular y a las modificaciones asociadas de las respuestas de la planta en su interacción con el entorno
• Comprender la importancia del desarrollo del sistema nervioso. Adquirir conocimientos avanzados sobre los mecanismos implicados en la formación del sistema nervioso.     
• Conocer los mecanismos celulares y moleculares avanzados que subyacen a la diferenciación de las neuronas y a la generación de la diversidad neuronal.     
• Comprender los mecanismos implicados en la formación de los circuitos neurales. Conocer las bases celulares y moleculares de la plasticidad sináptica. 
• Comprensión de la relevancia del estudio de los sistemas vivos a escala Genómica, el análisis del proteoma y la biología de sistemas.
• Aprendizaje de los conceptos fndamentales y la terminología especializada de la Genómica Estructural y Funcional
• Adquisición de conocimientos sobre organización y estructura de los genomas y su análisis
• Comprensión de los principios específicos de detección de biomoléculas y de la tecnología del DNA recombinante.
• Conocimiento de las tecnologías de análisis de alto rendimiento: Secuenciación de genomas, transcriptómica y proteómica.
• Adquisición de conocimientos sobre la construcción y análisis de micromatrices de diversas biomoléculas, en especial de DNA y proteínas.
• Conocimientos sobre análisis proteómico y tecnologías implicadas.
• Adquisición de conocimientos y habilidades sobre procedimientos y herramientas Bioinformáticas para el análisis de resultados: pruebas estadísticas y ajustes para comparaciones múltiples, análisis de perfiles de expresión y análisis de agrupamiento.
• Adquisición de nociones avanzadas de análisis de alto rendimiento de metabolitos (metabolómica).
• Conceptos y conocimientos avanzados sobre los recursos y habilidades para la organización análisis e integración de la información biológica derivada de la Genómica, Proteómica y Metabolómica (estructuras de biomoléculas y modelización in silico de procesos biológicos).
• Conocer la estructura de la neurona y comprender la relación de ésta con su función en la comunicación intercelular
• Comprender los mecanismos avanzados de la transmisión sináptica
• Conocer distintos sistemas de neurotransmisores y sus receptores
• Conocer los aspectos fundamentales de la plasticidad sináptica
• Conocer cómo están formados los circuitos neuronales elementales
• Conocer las características específicas de los procesos patológicos que pueden observarse en los diferentes órganos y sistemas de animales acuáticos.
• Adquirir conocimientos especializados sobre la inmunología de peces y sobre los mecanismos de defensa de invertebrados.
• Conocer las características epidemiológicas y las consecuencias económicas de las  enfermedades microbianas más importantes que afectan a especies acuícolas cultivadas.
• Conocer las principales estrategias de control de las enfermedades de animales acuáticos en cultivo.
• Conocer los fundamentos de los diferentes métodos utilizados para el diagnóstico de estas enfermedades.
• Conocer y saber manejar las fuentes documentales específicas de la Patología en acuicultura..
• Conocer y saber manejar las fuentes documentales específicas de la Patología Vegetal.
• Adquirir competencias prácticas mínimas para poder desenvolverse con soltura en un laboratorio de Sanidad Vegetal.
• Saber aplicar correctamente las técnicas de aislamiento de bacterias y hongos a partir de material vegetal infectado y conocer e interpretar las principales pruebas de diagnóstico de bacterias y hongos fitopatógenos.
• Dominar algunos métodos de investigación específicos de la Patología Vegetal como los relacionados con el estudio de factores de virulencia y el análisis de marcadores de defensa.
• Comprender y valorar de forma crítica  la importancia del desarrollo tecnológico en Biología Molecular para el avance en el conocimiento de los sistemas biológicos, particularmente el impacto económico y social de técnologías avanzadas tales como la transgénesis (OMGs)
  Ser capaz de identificar y caracterizar a nivel molecular un gen concreto a partir de la complejidad de un genoma
• Conocer detalladamente las herramientas moleculares disponibles para la obtención de organismos geneticamente modificados, así como las aplicaciones de estas tecnologías.
• Ser capaz de asimilar los conceptos avanzados que forman el fundamento de la emergente Biología de Sistemas
• Adquirir la capacidad para organizar, analizar e integrar la información derivada de la Genómica, Proteómica y Metabolómica
• Apreciar la importancia del desarrollo tecnológico en Biología Molecular para el avance en el conocimiento de los sistemas biológicos
• Adquirir un conjunto de habilidades avanzadas de investigación en laboratorio de Biología Celular y Molecular
• Localizar, seleccionar y elaborar la información relevante respecto del tema específico del trabajo de fin de Máster que haya sido elegido.
• Dominar la redacción científica respecto del tema específico del trabajo de fin de Máster que haya sido elegido, utilizando con fluidez la terminología de la disciplina en la que se enmarque dicho trabajo.
• Aprender técnicas avanzadas de manejo y procesamiento de imágenes relacionadas con el tema del trabajo de fin de Máster que haya sido elegido.
• Adquirir habilidades de exposición pública del tema específico del trabajo de fin de Máster que haya sido elegido, siendo capaz de integrar los conceptos y las imágenes adecuadas a dicho tema específico.